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基于中性粒细胞胞外诱捕网（NETs）与NK细胞的关系做一个小的课题设计之前帮客户设计研究方案时了解到了NETs（中性粒细胞胞外诱捕网）相关知识，结果发现这类研究在肿瘤领域的新颖性还挺不错，包括TCGA数据挖掘方面的论文也都是近几年才发表的。
可以看到，生信套路类的NETs相关文章发表的期刊一般都是Frontiers出版的，不过，不少都是IF>5的，对于单位要求不高的朋友来说，还是挺不错的！ NETs与NK细胞关系研究进展
△图片来源：文献1 自然杀伤（NK）细胞是先天性免疫细胞的一个重要亚群，对肿瘤免疫监视至关重要。一项研究表明，NETs（中性粒细胞胞外诱捕网）可通过上调 LGAS9 和 CEACAM1 基因抑制 NK 细胞的功能，而这些基因是 COVID-19 患者 NK 细胞的负调控因子。其他研究小组证实，NET 可使蜕膜 NK 细胞聚集，从而导致系统性红斑狼疮患者胎盘免疫功能紊乱。此外，NETs 的重要成分 CG (cathepsin G) 会裂解 NK 细胞相关的激活受体 NKp46，从而进一步损害 NK 细胞的功能，包括 IFN-γ 的产生和细胞脱颗粒，这表明 NETs 可能会抑制 NK 细胞的抗肿瘤反应。反过来，NK 细胞也会通过 IFN-γ 的分泌诱导 NET 的形成，从而进一步促进血栓的形成。NETs 还能包裹和包覆肿瘤细胞，使其免受 CD8+ T 细胞和 NK 细胞介导的细胞毒性的影响，从而阻碍免疫细胞与周围靶肿瘤细胞的接触，进一步阻碍免疫细胞对肿瘤转移的控制。NET可大大抵消NK细胞疗法的疗效，并导致HCC复发。抑制 NET 可增强 NK 细胞输注杀死癌细胞的能力。NET上调血管生成素-2（ANGPT2），而ANGPT2与巨噬细胞M0、NK细胞静息和肥大细胞活化显著相关，这表明NET可能参与了胃癌免疫微环境的调控。——文献1
△图片来源：文献1 先让ChatGPT (GPT-4)来设计一个 将上述内容输入到ChatGPT（国内平替版：https://sci.justscience.cn/chatgpt）中，选择GPT-4模型，同时输入指令：根据以上知识点，设计一个科研方案，重点研究NETs在结肠癌中对NK细胞、肿瘤发生发展的调控机制。得到了下面一个方案，大家先看看如何。
也许是我的要求太粗糙，所以设计出来的方案也非常大而空... 另外，OpenAI确实有钱，随便一设计预算就得要20万美元... 我的设计 因为NETs在肿瘤中的研究近几年才兴起，所以，还有很多基础性的研究没有做，我们这个课题先夯实基础再进行下游机制研究。 1. NETs对NK细胞的影响 分组：NK、NK+中性粒细胞（直接接触）、NK+PMA诱导后的中性粒细胞、NK+分离的NETs 检测指标与方法：转录组（mRNA、lncRNA、miRNA）、蛋白组和代谢组学可以都来一遍！ 2. 组学结果验证 根据第三方公司给的生信分析报告，用qPCR、WB检测筛选出来的关键分子或感兴趣的分子表达水平。 完成上述内容的两个组学联合分析再加点验证发个2分左右SCI，目前我认为是很轻松的。不过，得赶紧！ 3. NETs处理后的NK细胞对肿瘤细胞的作用 分组：NK+肿瘤细胞、NETs处理后的NK+肿瘤细胞；接触和非接触式两种形式的共培养最好都做。 检测指标与方法：CCK-8检测细胞活力变化；流式检测细胞凋亡；Transwell检测细胞迁移。这里的细胞表型可根据自己感兴趣的或者基于前面的测序生信分析结果去选择，不一定都得做。 做到这里的话，发2分以上肯定是妥妥的了！目前情况下，冲刺3分也是值得试试的。 4. NETs与NK细胞互作关键分子的验证 根据目前的文献报道，NETs与肿瘤等细胞上的多种分子有直接的互作，例如CCDC25、TGF-β、Integrin β1、Integrin α5β1、Cathepsin S等。 分组：NK、NK+NETs、NK+PMA诱导的中性粒细胞 检测指标和方法：IF双标，共聚焦显微镜下观察NETs与上述细胞膜蛋白的共定位情况。 5. NETs与NK细胞互作的其它关键分子的筛选 如果前面结果是阴性的或者觉得那些分子都是已报道的，新颖性不够，还想继续研究NETs与NK细胞间的其它互作分子，IP、Co-IP这些手段就可以上了。具体就不写了。 以上做完，再补上突变相关序列后相应表型（NK表型及其对肿瘤细胞的影响等）变化的检测，发5分SCI也就够了。 请注意，以上设计的只是一个课题的骨架，要最终成功发表还要有血有肉，感兴趣的朋友可以作为一个参考，或者联系我们共商合作！19901610324（微信同号）。 最后，再让GPT-4（https://sci.justscience.cn/chatgpt）来评估一下上面的这个方案，看看有没有提出什么有价值的点。
参考文献 1. 10.3389/fimmu.2023.1135086 |
